Desde 1617 hasta 1621 dejó gobernar a su ministro favorito Luynes a quien le hizo caso sobre reconciliarse con su madre en 1620. Mas Luynes hizo fiascos con la administración y Luis debió de echarlo. Posó sus ojos sobre un clérigo llamado Armando du Plessis, luego más conocido como el cardenal Richelieu en 1624 empezando una larga y fructífera colaboración mutua hasta la muerte del prelado en 1642. Como se dio cuenta de que el clérigo hacía bien los deberes, lo dejó gobernar como mejor le pareciera. Con Richelieu había tres metas: arruinar el partido calvinista, abatir la nobleza facciosa y luchar contra los Habsburgos.

En 1625 Richelieu encierra a los hugonotes en La Rochelle haciendo un largo sitio hasta 1628 cuando finalmente cayó ese puerto sin recibir más ayuda inglesa. Mas respeta el culto protestante en recuerdo de Enrique IV pero a la vez elimina las plazas fuertes militares de los hugonotes. Finalmente se ha acabado la guerra de Religión.

Contra los Grandes del reino, Richelieu debió batallar ferozmente inclusive contra Gastón de Orleans, hermano codicioso de Luis XIII. En muchos de los casos, el cardenal temió por su puesto pero jamás el rey le retiró la confianza puesta en él. Gracias a él, Luis estaba teniendo un estado fuerte y centralizado, una Academia Francesa y leyes tipificadas para el crimen.

En el exterior, ambos grandes hombres se metieron en la Guerra de los Treinta Años a partir de 1635 con el fin de jorobar a los Habsburgos. Siendo inicialmente derrotados, Luis XIII los vence hacia 1643 ganando el Artois y el Rosellón. Pero no solo eso pudo exhibir como conquista ya que Luis XIII ha sabido construir un imperio colonial en el Canadá, las Antillas y Africa.

Se había casado con Ana de Austria pero nunca se llevaban bien, se odiaban y jamás se pudieron entender. Por esa razón, tardaron hasta 1638 en tener a su primer hijo Luis XIV concebido en un encuentro casual y coincidente en un refugio de caza donde han ido a guarnecerse de una tormenta sin saber que el otro también estaba ahí. Dos años más tarde tuvieron a Felipe, fundador de la casa de Orleans para luego el rey morir prematuramente en 1643.